เกิดการก่อการร้ายพร้อมกันหลายจุด ทั้งสถานที่จัดการประชุมสุดยอดและที่ที่มีการเฝ้าระวังอย่างเข้มงวดในตัวเมือง! โคนันกับอามุโร่จึงต้องร่วมมือกันสืบหาแผนการร้ายที่ซ่อนอยู่เบื้องหลังคดีและเป้าหมายของคนร้ายตัวจริง...!! แต่คดีกลับพลิกผันไปไกลเกินกว่าที่คาด...!? เรื่องราวการสืบสวนภารกิจลับสุดยอดจบลงอย่างสมบูรณ์ที่นี่!